Critical Sectionถ้า a write operation ไปยัง the FAT volume ถูกอินเตอร์รัพท์เนื่องจาก an accidental failure, อย่างเช่น sudden blackout, wrong media removal และ unrecoverable disk error, the FAT structure on the volume สามารถถูกทำให้แตก. ภาพต่อไปนี้แสดง the critical section of the FatFs module.

An interruption ใน the red section อาจทำให้เกิด a cross link; ด้วยเหตุนี้, the object ที่กำลังถูกเปลี่ยนอาจสูญหายได้. ถ้า an interruption ใน the yellow section ถูกทำให้เกิดขึ้น, มีอย่างน้อยหนึ่งรายการที่อาจเป็นได้ข้างล่าง.
• The file data ที่กำลังถูกเขียนใหม่ถูกยุบ.
• ไฟล์ที่กำลังถูกต่อท้ายจะคืนค่าสถานะเริ่มต้น
• ไฟล์ที่สร้างใหม่หายไป
• ไฟล์ที่สร้างใหม่หรือเขียนทับจะยังคงอยู่ แต่ไม่มีเนื้อหา
• ประสิทธิภาพของการใช้ดิสก์แย่ลงเนื่องจากคลัสเตอร์สูญหาย
แต่ละ case ไม่ส่งผลกระทบต่อ file ใดๆที่ไม่เปิดใน write mode. เพื่อให้ความเสี่ยงลดลงต่ำที่สุดของ data loss, the critical section สามารถถูกทำให้ลดลงต่ำที่สุดโดยการลดลงต่ำที่สุดเวลาที่ file ถูกเปิดใน write mode หรือการใช้ f_sync function ดังแสดงใน Figure 5.